藏羚羊

助力高原动物微生物研究,CNGBdb发布

发布时间:2022/8/3 15:10:09   

年5月24日,由云南大学云南生物质源维护与哄骗国度中心测验室、国度基因库、深圳华大性命科学探索院共通开辟的青藏高原动物微生物质源库在国度基因库性命大数据平台(CNGBdb)正式上线。

青藏高原动物微生物质源库

青藏高原被称为“寰球第三极”,具备低氧、高寒、强紫内线、食品缺乏等极其处境特色。高原特有的动物类群,例如牦牛、藏羚羊、藏野驴、高原鼢鼠、高原鼠兔等,经验了长远的果然筛选,孕育了奇特的基因库,不但包罗动物宿主自己编码的基因,还包罗共生微生物编码的数目硕大的基因库,特殊是肠道微生物组编码的基因数目高出了宿主基因的最少倍。往常的探索对青藏高原动物自己基因组有了系统的分化和认知,然则针对共生微生物组,特殊是肠道微生物组仍缺少周全且深入的探索。

青藏高原动物微生物组蓄意曾经孕育了最少30Tb的动物肠道微生物宏基因组数据,借助扶植组、代谢组等多组学对象以及无菌动物功效考证,为领会物种在极其处境下适响应衍化的组学机制供应崭新的视角,也为肠道微生物物种和基因资本的开垦、维护和可陆续哄骗供应资本支柱和手艺参考。

基于此,云南大学云南生物质源维护与哄骗国度中心测验室联袂国度基因库、深圳华大性命科学探索院,共通开辟青藏高原动物微生物质源库(??点击文末“浏览原文”,即时拜访),分享肠道微生物宏基因组数据、可扶植菌株讯息、庞大项目及时发展、财产变化发展等,以期增进对高原动物共生微生物组(特殊是肠道微生物组)的系统、深入探索和运用开辟。

方今,青藏高原动物微生物质源库已上线4个项目,包罗8种高原动物的原形讯息及25.91TB宏基因组测序数据(均为受控数据,猎取前需求请求受权)。

原形操纵指派

用户可经过首页探求框直接探求项目或物种,直接加入项目详情页和物种详情页:项目详情页中包罗项目形貌、数据讯息及关连物种,点击关连物种可加入物种详情页;物种详情页包罗物种原形讯息、参考文件及关连项目,点击关连项目可加入项目详情页。

也可经过导航栏“科学探索”栏目→点击单个项目,便可加入项目详情页;“高原动物”栏目→点击单个物种,便可加入物种详情页。

青藏高原动物微生物质源库的修建遭到青藏高原第二次归纳科考、国度果然科学基金以及云南省中心范围科技蓄意等项目援助,后续将陆续革新物种讯息、探索发展、宏基因组数据和可扶植菌株资本。

*特殊注明:倘使您对青藏高原动物微生物质源库中触及的宏基因组数据或菌株资本感兴味,可经过导航栏“列入咱们”栏目提交讯息与咱们关联。

云南生物质源维护与哄骗国度中心测验室

生物百般性的探索是人类明白性命、正当哄骗生物质源和社会可陆续发展的严重原形。云南是我国以至寰球上生物百般性最充分和种质资本最召集的地域之一。为增强云南及西部生物百般性的维护和哄骗,依靠云南大学和云南农业大学现有的2个云南省和教导部共开国度中心测验室扶植基地、3个省部共建中心测验室、3个云南省中心测验室的原形上,调整两校关联上风力气,组建了“省部共建云南生物质源维护与哄骗国度中心测验室”。年12月该中心测验室经过老手验收并正式运转。

CNGBdb

国度基因库性命大数据平台(CNGBdb)(??明白详情)做为国内最大的生物大数据中央之一,会集了国度基因库及寰球其余严重数据源的公布数据,同时供应可托同享推算平台等多种运用功具,努力于为科研办事者供应生物大数据同享和运用效劳。

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